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analysedonnees:gestion_memoire_r

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analysedonnees:gestion_memoire_r [2020/03/14 15:52]
eorn créée
analysedonnees:gestion_memoire_r [2021/08/16 14:13]
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-===== Mieux gérer la mémoire sur R ===== 
  
-==== Dans R : supprimer des objets ==== 
-On peut utiliser ''​rm(objet)''​ pour suprimer ''​objet''​ de la mémoire de R. 
-Ça ne libère pas tout de suite la mémoire, pas tant qu'il manquera réellement de la mémoire pour R. 
- 
-On peut forcer cette suppression en lançant la commande ''​gc()''​. 
- 
- 
-==== Limiter la mémoire d'un processus (R/RStudio par exemple) ==== 
-Pour ne pas qu'un processus (R ou RStudio par exemple) dépasse une limite qu'on aura fixée, on peut utiliser ''​cgroup''​. Voilà comment on procède : 
- 
-1. **Installer ''​libcgroup''​** (sur Archlinux c'est dans AUR) 
- 
-2. **Créer un ''​cgroup''​** 
-<​code>​ 
-sudo cgcreate -t $USER:$USER -a $USER:$USER -g memory:​myGroup 
-</​code>​ 
-Ici, ''​$USER''​ c'est vous. 
- 
-3. **Configurer la limite de mémoire** 
-Après la précédente commande, ''​$USER''​ a accès au dossier ''/​sys/​fs/​cgroup/​memory/​myGroup''​. 
-On peut mettre une limite comme ceci (limiter à 500 Mo): 
-<​code>​ 
-echo 500000000 > /​sys/​fs/​cgroup/​memory/​myGroup/​memory.limit_in_bytes 
-</​code>​ 
- 
-4. **Lancer la commande soumise à cette limite** 
-<​code>​ 
-cgexec -g memory:​myGroup rstudio 
-</code 
- 
- 
-Deux notes importantes : 
-  * une fois que la limite est atteinte, le processus utilisera la swap, ça peut ralentir pas mal. 
-  * je crois qu'il faut, à chaque redémarrage,​ relancer les commandes 2-4. 
analysedonnees/gestion_memoire_r.txt · Dernière modification: 2021/08/16 14:13 (modification externe)